Крупнейшее в истории исследование городских микробиомов провели ученые из разных стран.
Ученые выяснили, что каждый город обладает собственным «молекулярным эхо». Как выразился один из авторов исследования, профессор медицины Кристофер Мейсон, «дайте мне свой ботинок и я с точностью 90% назову город, откуда вы приехали».
На протяжении трех лет в 60 городах на шести континентах ученые собрали и проанализировали образцы микроорганизмов (всего 4728 проб), уделяя особое внимание транспорту и больницам. В результате удалось создать первый систематический всемирный каталог городской микробной экосистемы, сообщает «МИР 24» со ссылкой на Cell.
Исследователи доказали, что основной «набор» из 31 вида микробов встречается практически везде — его выявили в 97% образцов. Ученые идентифицировали 4246 известных видов городских микроорганизмов. Однако в каждой новой пробе были обнаружены ранее неизвестные науке разновидности.
Обработка данных производилась на суперкомпьютере Extreme Science and Engineering Discovery Environment (XSEDE) в Питтсбурге, что привело к открытию 10 928 вирусов и 748 бактерий, которые не присутствовали ни в одной справочной базе.
На Земле существуют миллионы видов микробов, но в данный момент секвенированы геномы только 100-200 тысяч. Открытие новых видов поможет проследить связи между ними, построить генеалогические деревья микробов. Многие ранее неизвестные микроорганизмы могут иметь большой потенциал в медицинской области.
«Люди часто думают, что тропический лес — это изобилие биоразнообразия и новых молекул для лечения, но то же самое относится и к перилам метро или скамейке», — подчеркнул Кристофер Мейсон.